a6m33bin, b4m36bin -- Bioinformatika

Cílem předmětu je vysvětlit principy algoritmů používaných pro zpracování biologických dat na molekulární úrovni, konkrétně algoritmů používaných pro sekvenování genomů, srovnávání biologických sekvencí (zejm. genů), jejich pravděpodobnostní a gramatické modelování, pro hledání souvislostí mezi primární a vyššími strukturami proteinů, jejich funkcemi a interakcemi, pro analýzu dat vysoce paralelních měření (zejm. genové exprese) a pro systémově-biologické modelování procesů jako je metabolismus a regulace genové exprese.

• Garant: Filip Železný
• Přednášející: Jiří Kléma, Filip Železný
• Cvičící: František Malinka, Jáchym Barvínek, Petr Ryšavý
• Požadavky a hodnocení předmětu.
• Program a obsah přednášek a cvičení.

• Rozvrh předmětu.
• Sylabus předmětu na fakultním webu.
• Diskusní fórum.
• Odevzdávání úloh.

• Durbin et al.: Biological Sequence Analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids, Cambridge University Press, 1998.
• Lesk, A.M.: Introduction to Bioinformatics. Oxford University Press, 4th Edition, 2014.