Search
Znění úkolů pro cvičení: 06_cviceni_zadani.pdf
Dokumentace a specifikace Open-MPI
Tutoriál Wes Kendall
Program pro úkol č.2 (testovací program):
#include <stdio.h> #include "mpi.h" int main(int argc, char *argv[]) { int numprocs, rank, namelen; char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME]; MPI_Init(&argc, &argv); MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &numprocs); MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank); MPI_Get_processor_name(processor_name, &namelen); printf("Hello from process %d out of %d on %s\n", rank, numprocs, processor_name); MPI_Finalize(); return 0; }
Kompilace:
mpiCC progam.c -lm -o program
1. Vygenerovat ssh
/usr/bin/ssh-keygen -N "" -t ecdsa -f ~/.ssh/id_ecdsa cd ~/.ssh/ cat id_ecdsa.pub >> authorized_keys chmod -c 600 authorized_keys
nebo jednodušeji
ssh-keygen ssh-copy-id login@localhost
ssh-copy-id zajistí zkopírování veřejného klíče ~/.ssh/id_rsa.pub nebo ~/.ssh/id_ecdsa do authorized_keys' cílového počítače. V tomto případě na vlastní počítač přes SSH. Je přitom nutné zapsat heslo k vašemu účtu. Na další počítače v laboratoři již není třeba klíče kopírovat, protože na všech je váš domovský adresář s klíči montovaný ze shodného zdroje na NFS. Adresář se ale na jednotlivé stanice připojuje až po prvním přihlášení studenta, která vyžaduje uvést heslo. Adresy počítačů v laboratoři jsou ve tvaru 192.168.202.101 až 192.168.202.120''.
ssh-copy-id
~/.ssh/id_rsa.pub
~/.ssh/id_ecdsa
authorized_keys' cílového počítače. V tomto případě na vlastní počítač přes SSH. Je přitom nutné zapsat heslo k vašemu účtu. Na další počítače v laboratoři již není třeba klíče kopírovat, protože na všech je váš domovský adresář s klíči montovaný ze shodného zdroje na NFS. Adresář se ale na jednotlivé stanice připojuje až po prvním přihlášení studenta, která vyžaduje uvést heslo. Adresy počítačů v laboratoři jsou ve tvaru
až
2. nejprve s pomoci ssh se prihlasit na vypucetni uzly
3. Spustit
mpirun --host 192.168.202.101,192.168.202.102 -np 2 ./program
Zjištění IP adresy: Pro zjištění IP adresy počítače můžete použít následující kód. Za to patří dík Martinovi Velekovi. Poznámka: Pointer, který vrací getenv() používejte pouze pro čtení řetězce, na který ukazuje. Další volání getenv() může změnit jeho obsah.
#include <string.h> char* remote_ip = getenv("SSH_CONNECTION"); char localhost[] = "localhost"; char * pch; if(NULL != remote_ip) { pch=strchr(remote_ip,' '); pch=strchr(++pch,' '); remote_ip = ++pch; } else remote_ip = localhost;
Nastavení NetBeans pro správnou kompilaci vytvářených programů:
C Compiler: - Include directories: .../Program Files/MPICH2/include Linker: - Additional Library directories: .../Program Files/MPICH2/lib - Libraries: mpi.lib
Kompilace programu program.c z příkazového řádku Cygwin “Cygwin Bash Shell” (čili bez použití NetBeans) pomocí g(gcc, mpiCC): <code> g++ program.c -I"C:\Program Files\MPICH2\include" -L"C:\Program Files\MPICH2\lib" -lmpi </code> \\ \\ Pro **spouštění MPICH2 programů** se používá mpiexec.exe. Na každém uzlu/počítači musí běžet smpd.exe (manažér MPICH2 procesů). Program mpiexec.exe můžete ovládat z příkazové řádky, nebo pomocí grafického rozhraní wmpiexec.exe. Na obrázku níže je uveden příklad jak lze spouštět program. \\ {{courses:B4M35PAP:tutorials:06:wmpiexec.jpg }} Dostupnost a jména okolních počítačů lze zjistit pomocí wmpiconfig.exe jak ilustruje obrázek níže (zeleně zvýrazněné položky jsou dostupné). Nejdřív třeba kliknout na Get Hosts, pak na Scan Hosts. Pozn.: Nezapomeňte mít potřebné knihovny v adresáři s vlastním programem (typicky: cyggcc_s-1.dll, cyggomp-1.dll, cygstdc++-6.dll, cygwin1.dll).