This is the main wiki page for labs in Medical Imaging Systems (codes BAM33ZSL, BEAM33ZSL, A6M33ZSL).
Course tutors:
No. | Date | Lecturer | Topic | Homework |
---|---|---|---|---|
1. | Wed 16.2. | JS, JA, SK | fMRI acquisition in Motol hospital | Matlab intro. |
2. | Wed 23.2. | JS, SK | fMRI acquisition in Motol hospital | Matlab cell segmentation |
3. | Wed 02.3. | JS, SK | fMRI acquisition in Motol hospital | Matlab statistical test: t-test |
4. | Wed 09.3. | SK | Microscopy | see the page for homework: Microscopy |
5. | Wed 16.3. | JS, SK | fMRI processing, part 1 in Czech and in English. Please install SPM12 and download the data. On the lab computers, SPM12 is installed in /opt/MATLAB/spm12 and it is enough to add the path. | |
6. | Wed 23.3. | JS, SK | fMRI processing, part 2 | see last page of the lab notes. For questions about fMRI processing, please contact Jan Šanda. For administrative matters, problems with uploading the reports etc., please contact Sumit Kaushik. |
7. | Wed 30.3. | SK | Diffusion tensor MRI (DT-MRI) | see the page for homework: DTMRI |
8. | Wed 06.4. | JA | CT segmentation | see the page for homework: CT segmentation |
9. | Wed 13.4. | JA | CT forward and backward projection | see the page for homework: CTForward_Backward_Projection |
10. | Wed 20.4. | JA | CT Reconstruction | see the page for homework: CT ART |
11. | Wed 27.4. | JA | Ultrasound- theory | see the page for homework Ultrasound theory |
12. | Wed 04.5. | JA | Ultrasound scanner properties - IMPORTANT practical measurements with US device, no class this week in E132 | instructions, reservation table |
Wed 11.5. | Rector's day (no classes) | |||
13. | Wed 18.5. | JA | Test practice-Q&A |
* Ilustrační obrázky, jsou-li požadovány, všechny ilustrace musí mít popisek, odkazuje se z textu na obrázek, ne naopak.
Na cvičeních budete používat systém Matlab, který sdružuje prostředky pro výpočty, vizualizaci, ladění a programování numerických úloh. Jedná se o široce rozšířeným systémem pro vědecko-technicé výpočty. Je používán na více než 3500 universitách a ve stovkách velkých firem, koukněte např. sem.
Jak ho získat
Matlab není zadarmo. Nicméně studující si mohou doma pro účely studia nainstalovat multilicenci ČVUT Matlabu s pomocí hlavního přístupového hesla.
Jak začít
Předpokládáme základní znalost prostředí Matlab, pokud si znalosti chcete osvojit, doplnit či připomenout, doporučujeme následující tutoriál (cz) a další materiály z webu.
We will use Matlab for computation, visualization and other numerical calculations. Matlab is commonly used tool in research and development from academia to private companies.
How to get it
For study purposes, students are allowed to use the CTU multi-licence of Matlab on their own computers. The main CTU password is required for downloading.
How to start
Please use one of the web tutorials to freshen or improve your MATLAB experience.