Table of Contents

6. Cvičení - Paralelní programy pro DMS (jazyk C + MPI)

Znění úkolů pro cvičení: 06_cviceni_zadani.pdf

Dokumentace a specifikace Open-MPI

Tutoriál Wes Kendall

Program pro úkol č.2 (testovací program): 

#include <stdio.h>
#include "mpi.h"
 
int main(int argc, char *argv[]) {
  int numprocs, rank, namelen;
  char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];
 
  MPI_Init(&argc, &argv);
  MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &numprocs);
  MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
  MPI_Get_processor_name(processor_name, &namelen);
 
  printf("Hello from process %d out of %d on %s\n",
          rank, numprocs, processor_name);
 
  MPI_Finalize();
  return 0;
}


Linux:

Kompilace: 

mpiCC progam.c -lm -o program

Pro spouštění programů se používá mpirun. Postupujte v těchto krocích:

1. Vygenerovat ssh 

 /usr/bin/ssh-keygen -N "" -t ecdsa -f ~/.ssh/id_ecdsa
 cd ~/.ssh/
 cat id_ecdsa.pub >> authorized_keys
 chmod -c 600 authorized_keys

nebo jednodušeji 

ssh-keygen
ssh-copy-id login@localhost

ssh-copy-id zajistí zkopírování veřejného klíče ~/.ssh/id_rsa.pub nebo ~/.ssh/id_ecdsa do authorized_keys' cílového počítače. V tomto případě na vlastní počítač přes SSH. Je přitom nutné zapsat heslo k vašemu účtu. Na další počítače v laboratoři již není třeba klíče kopírovat, protože na všech je váš domovský adresář s klíči montovaný ze shodného zdroje na NFS. Adresář se ale na jednotlivé stanice připojuje až po prvním přihlášení studenta, která vyžaduje uvést heslo. Adresy počítačů v laboratoři jsou ve tvaru 192.168.202.101 až 192.168.202.120''.

2. nejprve s pomoci ssh se prihlasit na vypucetni uzly

3. Spustit 

 
mpirun --host 192.168.202.101,192.168.202.102 -np 2 ./program


Zjištění IP adresy:
Pro zjištění IP adresy počítače můžete použít následující kód. Za to patří dík Martinovi Velekovi. Poznámka: Pointer, který vrací getenv() používejte pouze pro čtení řetězce, na který ukazuje. Další volání getenv() může změnit jeho obsah. 

#include <string.h>
char* remote_ip = getenv("SSH_CONNECTION");
char localhost[] = "localhost";
char * pch;
if(NULL != remote_ip)
{
   pch=strchr(remote_ip,' ');
   pch=strchr(++pch,' ');
   remote_ip = ++pch;
}
else remote_ip = localhost;


Windows:

Kompilace:

Nastavení NetBeans pro správnou kompilaci vytvářených programů:

Soubor → Project Properties: 
C Compiler:
  - Include directories: .../Program Files/MPICH2/include
Linker:
  - Additional Library directories: .../Program Files/MPICH2/lib
  - Libraries: mpi.lib

Kompilace programu program.c z příkazového řádku Cygwin “Cygwin Bash Shell” (čili bez použití NetBeans) pomocí g(gcc, mpiCC): <code> g++ program.c -I"C:\Program Files\MPICH2\include" -L"C:\Program Files\MPICH2\lib" -lmpi </code> \\ \\ Pro **spouštění MPICH2 programů** se používá mpiexec.exe. Na každém uzlu/počítači musí běžet smpd.exe (manažér MPICH2 procesů). Program mpiexec.exe můžete ovládat z příkazové řádky, nebo pomocí grafického rozhraní wmpiexec.exe. Na obrázku níže je uveden příklad jak lze spouštět program. \\ {{courses:B4M35PAP:tutorials:06:wmpiexec.jpg