====== a6m33nin -- Neuroinformatika ======

====== Výuka | Course info ======

[[courses:a6m33nin:podminky|Podmínky předmětu a způsob hodnocení]]

[[http://www.fel.cvut.cz/cz/education/rozvrhy-ng.B172/public/cz/predmety/17/07/p1707106.html|Rozvrh A6M33NIN (LS 2018)]]
====== Zkouška | Exam ======

tbd

/* Zkouška bude ve čtvrtek 8.6.2015 od 10:00h místnost KN:E-128 

!! Zkouškové {{:courses:a6m33nin:otazky2017.pdf|OTÁZKY}} !!

*/

====== Kontakty | Contacts ======

Přednášející | //Lecturer//: [[xnovakd1@labe.felk.cvut.cz|Daniel Novák]] /*, [[vavrecka@fel.cvut.cz|Michal Vavrečka]]*/

Cvičící | Labs TA's: [[bakstedu@fel.cvut.cz|Eduard Bakštein]], [[stepakar@fel.cvut.cz|Karla Štěpánová]] /*,[[vavrecka@fel.cvut.cz|Michal Vavrečka]] */

[[https://cw.felk.cvut.cz/forum|Fórum]]

====== Přednášky | Lectures ====== 

  - 22.2: Úvod do neuroinformatiky, organizace předmětu, model membrány | //Introduction//   /* {{:courses:a6m33nin:lec1.pdf?nocache|Přednáška 1}} */
  - 1.3.: Modely neuronů: iontové kanály, synapse, Hodgkin-Huxley, Wilsonův model | //Neuron models// /* {{:courses:a6m33nin:lec2.pdf|Přednáška 2}} */
  - 8.3.: Hodgkin-Huxley + šíření AP | //HH model + AP propagation// /*{{:courses:a6m33nin:lec3.pdf|Přednáška 3}} */
  - 15.3.: Případová studie - Parkinsonova nemoc | //Case study: Parkinson's disease// (Eduard Bakštein) /* {{:courses:a6m33nin:lec4-2017-parkinson-handout.pdf|Přednáška 4}} */
  - 22.3.: LIF neuron, poissonův proces, variabilita pálení neuronu | //LIF model, Poisson process// /* {{:courses:a6m33nin:lec4.pdf|Přednáška 5}} */
  - 29.3: Prostorová navigace u zvířat | //Spatial orientation in animals// (Daniel Klement)  /* {{:courses:a6m33nin:lec11.pdf?nocache|Přednáška 5}} */
  - 5.4.: Populační modely, synaptická plasticita | //Network models, synaptic plasticity// /* {{:courses:a6m33nin:lec7.pdf|Přednáška 7}} */
  - 12.4: Vědomí, pozornost, emoce, paměť | Consciousness, attention, emotions, memory (Michal Vavrecka) /* {{:courses:a6m33nin:lec5_1.pdf|Přednáška 8}} */
  - 19.4: Připadová studie na optické metody zobrazování (Jakub Otáhal) | //Cortex modelling// /* {{:courses:a6m33nin:lec6.pdf?nocache|Přednáška 9}} */
  - 26.4: Náhodné sítě ex vivo a jejich modelování, /*{{:courses:a6m33nin:lec10.pdf?nocache|Přednáška 10}} */
  - 3.5: Samoorganizující se sítě, dynamické neuronové pole | //Self organizing maps //  /*  {{:courses:a6m33nin:lec11-som.pdf?nocache|Přednáška 11}} */
  - 10.5: Kódování, dekódování informace | //Information coding// /* {{:courses:a6m33nin:lecture_encoding-and-decoding-of-neural-information.pdf|Přednáška 12}} */
  - 17.5.: Učí se jako v úterý (náhradní výuka) /*Kódování, dekódování informace | //Information coding// /* {{:courses:a6m33nin:lec10.pdf?nocache|Přednáška 12}} */
  - 25.5: Kognitivní modelování | //Cognitive modelling// (Karla Štěpánová) /* {{:{{:courses:a6m33nin:lec13_cognitive.pdf|Přednáška 13}} */

/*
Materiály k přednáškám lze stáhnout [[https://147.32.84.236/teach/nin/doc/|zde]]. Přihlašovací údaje byly sděleny na přednáškách.
*/
====== Cvičení | Lab exercises ====== 
{{:courses:a6m33nin:a6m33ninlabs2017en.pdf|Instruction for lab exercises}} (update 20.4.2017)
/*
{{:courses:a6m33nin:a6m33nincviceni2015.pdf|Instrukce ke cvičení česky - pouze orientační}}(aktualizace 19.2.2015)*/

//Lab materials are published continuously during the semester in the list below. The PDF instructions will be continuously updated as well (remember to refresh the pdf page - F5!)//

Materiály ke cvičením budou průběžně zveřejňovány v seznamu cvičení, stejnětak PDF instrukce budou průběžně doplňovány (pokud zobrazujete stránku s pdf v prohlížeči, nezapomeňte ji obnovit - F5).

[[courses:a3b33kui:plagiaty|Co je a není plagiát?]]

[[http://cyber.felk.cvut.cz/teaching/studentcomp.phtml|konta na serveru KSTUDENT]]

/*
[[https://nit.felk.cvut.cz/teach/nin/doc/|Materiály ke cvičením]] (stejné místo i login jako u přednáškových slides)
*/
=====Program cvičení | Exercise materials=====
  - ** Matematický aparát: numerické metody řešení dif. rovnic | //Numerical integration - Euler's method// **
     * 22.2.2018
     * {{:courses:a6m33nin:cv:matlab_intro.m|}}
     * + bezpečnost práce /*
     * {{:courses:a6m33nin:cv:cv1_numint_base.m| zakladni reseni v matlabu}} (//basic solution in matlab//) */
  - ** Modelování neuronů I - RC a EPSP model | //Neuron models: RC and EPSP// **  
     * 1.3.2018 /*
     * {{:courses:a6m33nin:cv:cv2_2_epsp.m|cv2_epsp.m}} */
  - ** Modelování neuronů II - Hodgkin-Huxley | //Hodgkin-Huxley model// ** 
     * 8.3.2018 /*
     * {{:courses:a6m33nin:cv:cv3_hh.m|cv3_hh.m}} */
  - ** Poissonovský spiketrain  (+ LIF model) | //Poisson spiketrain// ** 
     * 15.3.2018 /*
     * {{:courses:a6m33nin:cv:cv4_lif.m|cv4_lif.m}} */
  - ** Vytváření simulovaného uEEG signálu, LIF model | //Generation of artificial uEEG, LIF model//**
     * 22.3.2018  /*
     * {{:courses:a6m33nin:cv6_realmeeg.mat|mEEG data}} (fs=24kHz) */
  - ** Porovnání simulovaných dat s reálnými s reálnými | //Comparison of real and simulated data//** /*
     * {{:courses:a6m33nin:cv7_spikeset.mat|Spike templates}} */
     * 28.3.2018 
  - ** Analýza reálných dat - Spike sorting  | //Analysis of real data - spike sorting//  **
     * 5.4.2018 /*
     * {{:courses:a6m33nin:cv:cv7_spikesorting_data.mat|spikesorting data}}
     * {{:courses:a6m33nin:cv:cv7_amp_detect.m|amp_detect}} */
  - ** Analýza reálných dat - okohybné pohyby | //Analysis of real data - eye movements//**
     * 12.4.2018  /*
     * {{:courses:a6m33nin:cv:cv8_eogdata.mat|eogData}} */
  - ** Hebbovské učení | //Hebb's learning// ** 
     * 19.4.2018 
  - ** Spontánní aktivita neuronových sítí  | //Spontaneous activity of simulated networks//**
     * 26.4.2018
  - ** Samoorganizující neuronové sítě | //Self-organizing maps// **
     * 3.5.2018     
  - ** Kognitivní modelování| //Cognitive modelling// **
     * 10.5.2018 /*
     * {{:courses:a6m33nin:a6m33ninlabs-cognitive.pdf|navod k uloze}}
     * {{:courses:a6m33nin:cv15-task01_instructions.pdf|návod k 1. části úlohy}}
     * {{:courses:a6m33nin:cv15-task02_instructions.pdf|návod k 2. části úlohy}} */
   - ** Výuka jako v úterý (cvičení odpadá) | // Tuesday's schedule (class cancelled)// **
     * 17.5.2018     
  - ** Kognitivní modelování: brain simulator, zápočet | //Cognitive modelling, assessment// **
     * 24.5.2018 /*
     * {{:courses:a6m33nin:cv:cv12_gm_distribution.zip|gm_distribution.m}}
     * {{:courses:a6m33nin:cv:cv12_lotto_missing_values.m|lotto_missing_values.m}} */