====== ZSL Zobrazovací systémy v lékařství / Medical Imaging Systems ======
===== Přednášky =====
/* Pondělí 9:15-10:45, KN:E-107 */
/* Ve středu 9:15-10:45, v místnosti KN:E-126 na Karlově náměstí. */
// Wednesday, 9:15-10:45, room KN:E-126, Charles square. //
/* Úterý 12:45-14:15, KN:E-107 (výjimečně pondělí 9:15-10:45, KN:E-107) */
Přednášející/Lecturer: [[http://cmp.felk.cvut.cz/~kybic/|Jan Kybic]] (není-li řečeno jinak)
/* [[http://cmp.felk.cvut.cz/~herinjan|Jan Hering]] (JH) */
/* [[http://cmp.felk.cvut.cz/~flachbor/|Boris Flach]] (BF) */
/* [[https://www.irisa.fr/visages/members/former/jan.petr/index|Jan Petr]] (JP) */
Prezenční přednášky jsou zrušeny. Výuka začne distančně v plánovaném čase (středa 17.2. v 9:15) pomocí platformy [[https://bigbluebutton.org/|BigBlueButton]]. Odkaz na připojení najdete v aplikaci [[https://cw.felk.cvut.cz/brute|BRUTE]] a také vám ho den před přednáškou pošlu emailem. Potřebujete pouze počítač s připojením na internet a reproduktorem, ideálně i mikrofonem. Budete mít k dispozici komentované verze většiny přednášek a další odkazované materiály, většinou kapitoly z knih. Ty není potřeba číst slovo od slova od začátku až do konce, obsahují více informací, než kolik potřebujete znát. Pokud nebudete něčemu rozumět, zeptejte se na na diskusním fóru předmětu nebo emailem. Dotazy k materiálům k přednáškách pište pomocí nástroje [[http://perusall.com|Perusall]], kód obdržíte také emailem. // Contact lectures are cancelled until further notice. The first lecture will happen at the planned time (Wednesday, February 17, at 9:15) via [[https://bigbluebutton.org/|BigBlueButton]]. You will find the link to connect in [[https://cw.felk.cvut.cz/brute|BRUTE]] and I will also send it you by email about one day in advance. You will have at your disposable the commented version of the lectures and other materials, mostly book chapters. These do not have to be read word-by-word, they usually contain much more than you need at this level. Ask question on the discussion forum of the course or by email. Questions to lecture materials can be asked via [[http://perusall.com|Perusall]], you will obtain the code by email later on.//
^Č. ^ Datum ^ Zdroj ^ Téma ^
^No ^ Date ^ Resources ^ Topic ^
^ 1|St 17.2.| {{medicalimagingintro2018.pdf|úvod}},{{microscopy.pdf|slidy}}, {{davidson-abramowitz-optical_microscopy.pdf|článek}}, [[https://bbb04.felk.cvut.cz//playback/presentation/2.0/playback.html?meetingId=fc5253a16154356252c54a3ab6408bb94e1bd814-1613549607416|záznam přednášky]] | Úvod. Optická mikroskopie, fluorescenční mikroskopie, elektronová mikroskopie. // Introduction, miscroscopy // (JH) |
^ 2|St 24.2.| {{x-rays.pdf|slidy}}, kapitola 2 knihy [[https://ebookcentral.proquest.com/lib/cvut/detail.action?docID=1438164&query=medical+imaging|Webb's Physics of Medical Imaging, 2nd ed.]], [[https://bbb04.felk.cvut.cz//playback/presentation/2.0/playback.html?meetingId=cf60643762ff2193f1d102ddd1d2d2c32556667f-1614153601572|záznam přednášky]] | Rentgen / //X-rays//, fyzikální principy, zdroje a detektory. |
^ 3|St 3.3.| {{ct-hozman-jk.pdf|}}, kapitola 3 knihy [[https://ebookcentral.proquest.com/lib/cvut/detail.action?docID=1438164&query=medical+imaging|Webb's Physics of Medical Imaging, 2nd ed.]], [[https://bbb04.felk.cvut.cz//playback/presentation/2.0/playback.html?meetingId=2ae43a4567ef1ee472fc04c5b68fc3ebb8d15ab3-1614758401226|záznam přednášky]] | Počítačová tomografie (CT), první část. |
^ 4|St 10.3.| {{ct-hozman-jk.pdf|}}, kapitola 3,4 knihy [[https://engineering.purdue.edu/~malcolm/pct/|Kok,Slaney]], kapitola 3 knihy [[https://ebookcentral.proquest.com/lib/cvut/detail.action?docID=1438164&query=medical+imaging|Webb's Physics of Medical Imaging, 2nd ed.]], [[https://bbb04.felk.cvut.cz//playback/presentation/2.0/playback.html?meetingId=8481890a2906435ddcd291d18683af90f653cc93-1615363202169|záznam přednášky]] [[https://youtu.be/8pVE4zQFX8s|komentovaná druhá část přednášky 2020]] | Počítačová tomografie, pokračování. 3D počítačová tomografie. // Computed tomography, cont. // |
^ 5|St 17.3.| {{ultrasound.pdf|}}, kapitola 6 knihy [[https://ebookcentral.proquest.com/lib/cvut/detail.action?docID=1438164&query=medical+imaging|Webb's Physics of Medical Imaging, 2nd ed.]], kapitola 7 knihy [[https://onlinelibrary.wiley.com/doi/book/10.1002/9780470918548|Medical image analysis]], [[https://bbb04.felk.cvut.cz//playback/presentation/2.0/playback.html?meetingId=1c145a51c30574fccb8907cfa4f55edc93616d20-1615968001945|záznam přednášky]], [[https://youtu.be/QnyjceDa6p0|komentovaná první část přednášky 2020]], [[http://folk.ntnu.no/stoylen/strainrate/Basic_ultrasound|Basic ultrasound for clinicians]] | Fyzika ultrazvuku. Generování a detekce ultrazvuku. Standardní lékařské ultrazvukové techniky. // Ultrasound //|
^ 6|St 24.3.| [[https://bbb04.felk.cvut.cz//playback/presentation/2.0/playback.html?meetingId=df72a60d0c4f15722e255e382810aac61390862b-1616572801138|záznam přednášky]], [[https://youtu.be/2Ork1XzWYYw|komentovaná druhá část přednášky 2020]], [[http://folk.ntnu.no/stoylen/strainrate/Basic_Doppler_ultrasound|Basic Doppler ultrasound]], dále viz materiály k první části | Moderní ultrazvukové zobrazování (Doppler, kontrastní látky, 3D). // Ultrasound, cont. // |
^ 7|St 31.3.| {{mri1.pdf|}}, [[https://bbb04.felk.cvut.cz//playback/presentation/2.0/playback.html?meetingId=78367caf423658a7c718d3f56f94c3ccfc4828a2-1617174001791|záznam přednášky]], [[http://www.cis.rit.edu/htbooks/mri/|Hornak:The Basics of MRI,kapitoly 1-3]], [[https://ebookcentral.proquest.com/lib/cvut/detail.action?docID=1438164&query=medical+imaging|Webb's Physics of Medical Imaging, 2nd ed.,kapitola 7.1-7.3]] [[ https://youtu.be/C_mhZYzMTBc|komentovaná první část přednášky o MRI 2020]] | Základy MRI. Fyzika magnetické rezonance. NMR spektroskopie. // MRI //|
^ 8|St 7.4.| {{mri2.pdf|}},[[https://bbb04.felk.cvut.cz//playback/presentation/2.0/playback.html?meetingId=f423c34d0e1a424bf7373fd594f1f54d28029fa5-1617778801907|záznam přednášky]][[http://www.cis.rit.edu/htbooks/mri/|Hornak:The Basics of MRI,kapitoly 4-7]], [[https://ebookcentral.proquest.com/lib/cvut/detail.action?docID=1438164&query=medical+imaging|Webb's Physics of Medical Imaging, 2nd ed.,kapitola 7.4-7.6.8]] [[https://youtu.be/S4DDkOWxNj8|komentovaná druhá část přednášky o MRI 2020]] | Principy MRI zobrazování. // MRI cont. // |
^ 9|St 14.4.| {{mri2.pdf|}},{{mri3.pdf|}}, [[http://www.cis.rit.edu/htbooks/mri/|Hornak:The Basics of MRI,kapitoly 8-11]], [[https://bbb04.felk.cvut.cz//playback/presentation/2.0/playback.html?meetingId=170d00cc4df6ff2d6f8285396e7c72a8838f0aea-1618383603241|záznam přednášky]], [[https://youtu.be/K5UObsYDGMU|komentovaná třetí část přednášky o MRI 2020]], [[https://youtu.be/muWAy5JPXow|komentovaná čtvrtá část přednášky o MRI]],[[https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/476931/MRI_guidance_2015_-_4-02d1.pdf|FDA MRI guidelines]], [[https://ebookcentral.proquest.com/lib/cvut/detail.action?docID=1438164&query=medical+imaging|Webb's Physics of Medical Imaging, 2nd ed.,kapitoly 7.6.11-7.6.13,7.8,7.10, 7.11]] | Fourierovské MRI. Excitační sekvence. Kontrast. //MRI cont.//|
^10|St 21.4. | {{mri4.pdf|}}, [[https://bbb04.felk.cvut.cz//playback/presentation/2.0/playback.html?meetingId=f960270b5c41939a6127f727891d40f442335bf6-1618988401411| záznam přednášky]], [[https://youtu.be/akhw5-s6qBE|komentovaná pátá část přednášky o MRI 2020]], [[http://www.cis.rit.edu/htbooks/mri/|Hornak:The Basics of MRI,kapitoly 12-15]], [[https://ebookcentral.proquest.com/lib/cvut/detail.action?docID=1438164&query=medical+imaging|Webb's Physics of Medical Imaging, 2nd ed.,kapitoly 7.6.13.2, 7.9, 7.12]] | MRI Hardware: magnet, civky. Artefakty, bezpečnost, // MRI, cont.//|
^11|St 28.4.| {{mri5.pdf|}} [[https://bbb04.felk.cvut.cz//playback/presentation/2.0/playback.html?meetingId=5dd886d0ad282891b4c8dbe405fd2396fb93cf69-1619593201190| záznam přednášky]] | Lékařské aplikace, speciální techniky. // MRI, cont.//|
^12|St 5.5.| {{fmri.pdf|}}, [[https://bbb04.felk.cvut.cz//playback/presentation/2.0/playback.html?meetingId=f94f43975f88c04a31df28ab05ecf8934932b58f-1620198001553|záznam přednášky]], [[https://youtu.be/cgVMl8z3Efg|komentovaná přednáška o fMRI 2020]], [[https://fmri-training-course.psych.lsa.umich.edu/2019-lecture-slides/|kurz U. Michigan]], [[https://www.biac.duke.edu/education/courses/fall04/fmri/|fMRI kurz Neurobio]] | Funkční MRI, mapování mozkových aktivit. // functional MRI // |
^ |St 12.5. | // rektorský den / rector's day, no courses // |
^13 |St 19.5.| {{petspect.pdf|}}, [[https://youtu.be/pZ205I75_Ic|komentovaná přednáška o PET/SPECT]], [[https://ebookcentral.proquest.com/lib/cvut/detail.action?docID=1438164&query=medical+imaging|Webb's Physics of Medical Imaging, 2nd ed.,kapitola 5]] | Radionuklidové zobrazovací techniky //(PET,SPECT)//.Rekonstrukční techniky pro PET a SPECT. |
/* ^13|St 20.5. | {{elastography.pdf}} {{meegeeg.pdf|}} | rezerva, opakování, další zobrazovací techniky - elastografie, MEG/EEG. Nebude součástí zkoušky. // Other medical imaging techniques // | */
/* {{:courses:a6m33zsl:elastography.pdf}} {{:courses:a6m33zsl:meegeeg.pdf|}} */
=====Hodnocení=====
*Informace o [[ZkouskaZSL|zkoušce]].
=====Studijní materiály / References =====
* Výše zmíněné materiály k přednáškám. // Lecture slides and other resources mentioned in the table above. //
* Flowe, M. A., Webb, S.: [[https://ebookcentral.proquest.com/lib/cvut/detail.action?docID=1438164&query=medical+imaging|Webb's Physics of Medical Imaging, 2nd ed.]], Chapman and Hall/CRC, 2012. e-kniha k dispozici v rámci ČVUT. // e-book available for CTU //
* Kok, Slaney: [[https://engineering.purdue.edu/~malcolm/pct/|Principles of Computerized Tomographic Imaging]] // e-book free for personal use //
* Webb A., Introduction to Biomedical Imaging. IEEE Press, 2003.
* Zuna, Poušek, Úvod do zobrazovacích metod v lékařské diagnostice. Skriptum ČVUT, 2002.
* Dhawan, A. Medical Image Analysis. IEEE Press, 2003. // [[https://aleph.cvut.cz/F/YE57FEBMAU47KVN63KV6UQQ4BN12137KXTPPR75G6U2YXB56NL-02490?func=full-set-set&set_number=985108&set_entry=000056&format=999|e-book available for CTU]] //
* Svatoš, J., Zobrazovací systémy v lékařství, skriptum ČVUT, 1998
* Cho, Z.H., Jones, J.P., Singh, M. Foundations of Medical Imaging. New York: John Wiley&Sons, Inc. 1993
* Hornak, J.: [[http://www.cis.rit.edu/htbooks/mri/|The Basics of MRI]]. // Free online book. //
* Kybic, J: {{:courses:zsl:kybic-kapitola12.pdf|Zobrazovací ́systémy v medicíně a zpracování obrazové informace v medicíně.}} Krátké shrnutí probírané látky.
Přístup k některým zdrojům je omezen na IP adresy ČVUT. Při přístupu z domova je nutné použít [[http://svti.fel.cvut.cz/cz/services/vpn.html|VPN]].