====== ZSL Zobrazovací systémy v lékařství / Medical Imaging Systems ======
===== Přednášky =====
/* Pondělí 9:15-10:45, KN:E-107 */
/* Ve středu 9:15-10:45, v místnosti KN:E-126 na Karlově náměstí. */
// Wednesday, 9:15-10:45, room KN:E-126, Charles square. //
/* Úterý 12:45-14:15, KN:E-107 (výjimečně pondělí 9:15-10:45, KN:E-107) */
Přednášející/Lecturer: [[http://cmp.felk.cvut.cz/~kybic/|Jan Kybic]] (není-li řečeno jinak) a
[[http://cmp.felk.cvut.cz/~herinjan|Jan Hering]] (JH)
/* [[http://cmp.felk.cvut.cz/~flachbor/|Boris Flach]] (BF) */
/* [[https://www.irisa.fr/visages/members/former/jan.petr/index|Jan Petr]] (JP) */
Přednášky jsou do odvolání zrušeny. Pokud vám to vyhovuje, pusťte si komentovanou verzi přednášek (budu postupně doplňovat). Pokud vám to nevyhovuje nebo pokud máte zájem o více informací, přečtěte si další odkazované materiály, většinou kapitoly z knih. Ty není potřeba číst slovo od slova od začátku až do konce, obsahují více informací, než kolik potřebujete znát. Pokud nebudete něčemu rozumět, zeptejte se na [[https://ist.cvut.cz/en/our-services/microsoft-teams/|MS Teams, team Predmet-B192-BAM33ZSL]] nebo [[mailto:kybic@fel.cvut.cz|emailem]]. Dotazy k materiálům k přednáškách pište pomocí nástroje [[http://perusall.com|Perusall]]. Na dotazy budu odpovídat průběžně, nejrychleji ve standardním čase výuky předmětu, tedy ve středu dopoledne.
^Č. ^ Datum ^ Zdroj ^ Téma ^
^No ^ Date ^ Resources ^ Topic ^
^ 1|St 19.2.| {{medicalimagingintro2018.pdf|úvod}},{{microscopy.pdf|slidy}}, {{davidson-abramowitz-optical_microscopy.pdf|článek}} | Úvod. Optická mikroskopie, fluorescenční mikroskopie, elektronová mikroskopie. // Introduction, miscroscopy // (JH) |
^ 2|St 26.2.| {{x-rays.pdf|}} | Rentgen / //X-rays//, fyzikální principy, zdroje a detektory. |
^ 3|St 4.3.| {{ct-hozman-jk.pdf|}} | Počítačová tomografie (CT), první část. |
^ |St 11.3.| | // přednáška odpadla kvůli COVID // |
^ 4|St 18.3.| {{ct-hozman-jk.pdf|}}, kapitola 3,4 knihy [[https://engineering.purdue.edu/~malcolm/pct/|Kok,Slaney]], kapitola 3 knihy [[https://ebookcentral.proquest.com/lib/cvut/detail.action?docID=1438164&query=medical+imaging|Webb's Physics of Medical Imaging, 2nd ed.]], [[https://youtu.be/8pVE4zQFX8s|komentovaná druhá část přednášky]] | Počítačová tomografie, pokračování. 3D počítačová tomografie. // Computed tomography, cont. // |
^ 5|St 25.3.| {{ultrasound.pdf|}}, kapitola 6 knihy [[https://ebookcentral.proquest.com/lib/cvut/detail.action?docID=1438164&query=medical+imaging|Webb's Physics of Medical Imaging, 2nd ed.]], kapitola 7 knihy [[https://onlinelibrary.wiley.com/doi/book/10.1002/9780470918548|Medical image analysis]], [[https://youtu.be/QnyjceDa6p0|komentovaná první část přednášky]], [[http://folk.ntnu.no/stoylen/strainrate/Basic_ultrasound|Basic ultrasound for clinicians]] | Fyzika ultrazvuku. Generování a detekce ultrazvuku. Standardní lékařské ultrazvukové techniky. // Ultrasound //|
^ 6|St 1.4.| [[https://youtu.be/2Ork1XzWYYw|komentovaná druhá část přednášky]], [[http://folk.ntnu.no/stoylen/strainrate/Basic_Doppler_ultrasound|Basic Doppler ultrasound]], dále viz materiály k první části | Moderní ultrazvukové zobrazování (Doppler, kontrastní látky, 3D). // Ultrasound, cont. // |
^ 7|St 8.4.| {{mri1.pdf|}}, [[http://www.cis.rit.edu/htbooks/mri/|Hornak:The Basics of MRI,kapitoly 1-3]], [[https://ebookcentral.proquest.com/lib/cvut/detail.action?docID=1438164&query=medical+imaging|Webb's Physics of Medical Imaging, 2nd ed.,kapitola 7.1-7.3]] [[ https://youtu.be/C_mhZYzMTBc|komentovaná první část přednášky o MRI]] | Základy MRI. Fyzika magnetické rezonance. NMR spektroskopie. // MRI //|
^ 8|St 15.4.| {{mri2.pdf|}},[[http://www.cis.rit.edu/htbooks/mri/|Hornak:The Basics of MRI,kapitoly 4-7]], [[https://ebookcentral.proquest.com/lib/cvut/detail.action?docID=1438164&query=medical+imaging|Webb's Physics of Medical Imaging, 2nd ed.,kapitola 7.4-7.6.8]] [[https://youtu.be/S4DDkOWxNj8|komentovaná druhá část přednášky o MRI]] | Principy MRI zobrazování. Fourierovské MRI. Excitační sekvence. // MRI cont. // |
^ 9|St 22.4.| {{mri3.pdf|}},{{mri4.pdf|}}, [[http://www.cis.rit.edu/htbooks/mri/|Hornak:The Basics of MRI,kapitoly 8-11]], [[https://youtu.be/K5UObsYDGMU|komentovaná třetí část přednášky o MRI]], [[https://youtu.be/muWAy5JPXow|komentovaná čtvrtá část přednášky o MRI]],[[https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/476931/MRI_guidance_2015_-_4-02d1.pdf|FDA MRI guidelines]], [[https://ebookcentral.proquest.com/lib/cvut/detail.action?docID=1438164&query=medical+imaging|Webb's Physics of Medical Imaging, 2nd ed.,kapitoly 7.6.11-7.6.13,7.8,7.10, 7.11]] | Kontrast. MRI Hardware: magnet, civky. Artefakty. Bezpečnost. //MRI cont.//|
^10|St 29.4. | {{mri5.pdf|}}, [[https://youtu.be/akhw5-s6qBE|komentovaná pátá část přednášky o MRI]], [[http://www.cis.rit.edu/htbooks/mri/|Hornak:The Basics of MRI,kapitoly 12-15]], [[https://ebookcentral.proquest.com/lib/cvut/detail.action?docID=1438164&query=medical+imaging|Webb's Physics of Medical Imaging, 2nd ed.,kapitoly 7.6.13.2, 7.9, 7.12]] | MRI, lékařské aplikace, speciální techniky. // MRI, cont.//|
^11|St 6.5.| {{fmri.pdf|}}, [[https://youtu.be/cgVMl8z3Efg|komentovaná přednáška o fMRI]], [[https://fmri-training-course.psych.lsa.umich.edu/2019-lecture-slides/|kurz U. Michigan]], [[https://www.biac.duke.edu/education/courses/fall04/fmri/|fMRI kurz Neurobio]] | Funkční MRI, mapování mozkových aktivit. // functional MRI // |
^12|St 13.5. | {{petspect.pdf|}}, [[https://youtu.be/pZ205I75_Ic|komentovaná přednáška o PET/SPECT]], [[https://ebookcentral.proquest.com/lib/cvut/detail.action?docID=1438164&query=medical+imaging|Webb's Physics of Medical Imaging, 2nd ed.,kapitola 5]] | Radionuklidové zobrazovací techniky //(PET,SPECT)//.Rekonstrukční techniky pro PET a SPECT. |
^13|St 20.5. | {{elastography.pdf}} {{meegeeg.pdf|}} | rezerva, opakování, další zobrazovací techniky - elastografie, MEG/EEG. Nebude součástí zkoušky. // Other medical imaging techniques // |
/* {{:courses:a6m33zsl:elastography.pdf}} {{:courses:a6m33zsl:meegeeg.pdf|}} */
=====Hodnocení=====
*Informace o [[ZkouskaZSL|zkoušce]].
=====Studijní materiály / References =====
* Výše zmíněné materiály k přednáškám. // Lecture slides and other resources mentioned in the table above. //
* Flowe, M. A., Webb, S.: [[https://ebookcentral.proquest.com/lib/cvut/detail.action?docID=1438164&query=medical+imaging|Webb's Physics of Medical Imaging, 2nd ed.]], Chapman and Hall/CRC, 2012. e-kniha k dispozici v rámci ČVUT. // e-book available for CTU //
* Kok, Slaney: [[https://engineering.purdue.edu/~malcolm/pct/|Principles of Computerized Tomographic Imaging]] // e-book free for personal use //
* Webb A., Introduction to Biomedical Imaging. IEEE Press, 2003.
* Zuna, Poušek, Úvod do zobrazovacích metod v lékařské diagnostice. Skriptum ČVUT, 2002.
* Dhawan, A. Medical Image Analysis. IEEE Press, 2003. // [[https://aleph.cvut.cz/F/YE57FEBMAU47KVN63KV6UQQ4BN12137KXTPPR75G6U2YXB56NL-02490?func=full-set-set&set_number=985108&set_entry=000056&format=999|e-book available for CTU]] //
* Svatoš, J., Zobrazovací systémy v lékařství, skriptum ČVUT, 1998
* Cho, Z.H., Jones, J.P., Singh, M. Foundations of Medical Imaging. New York: John Wiley&Sons, Inc. 1993
* Hornak, J.: [[http://www.cis.rit.edu/htbooks/mri/|The Basics of MRI]]. // Free online book. //
* Kybic, J: {{:courses:zsl:kybic-kapitola12.pdf|Zobrazovací ́systémy v medicíně a zpracování obrazové informace v medicíně.}} Krátké shrnutí probírané látky.
Přístup k některým zdrojům je omezen na IP adresy ČVUT. Při přístupu z domova je nutné použít [[http://svti.fel.cvut.cz/cz/services/vpn.html|VPN]].