V zásadě lze říct, že co bylo v přednáškách, může se objevit u zkoušky.
Základní pojmy - modelování, simulace, model, reálný objekt, abstrakce, interpretace, platnost, věrnost. Proč modelovat, důsledky, postup modelování, zjednodušování.
Systém - diskrétní, spojitý, stochastický, deterministický. Separabilita, stabilita. Formální a neformální popis.
Analogie fyzikálních domén. Zobecněné systémové vlastnosti. Vztahy zobecněných vlastností. Konceptuální modely, elektrické analogie. Vztah ke konektorům v Modelice.
Řešení ordinérních diferenciálních rovnic prvního řádu a ntého řádu. Řešení soustav. Charakteristický polynom. Řešení nelineárních rovnic a jejich řešitelnost.
Parciální diferenciální rovnice, jejich soustavy. Okrajové podmínky, řešitelnost.
Postup řešení soustavy DAE v Modelice, speciality při řešení hybridních modely a inicializaci.
Lineární systém a jeho hlavní vlastnosti. Laplaceova transformace, přenos systému (transfer function).
kompartment - zjednodušení, význam. Kompartmentové modelování. Využití v epidemiologii (SIR), fyziologii (objemové a koncentrační kompartment) a farmakologii (modely 0, 1 a 2 řádu, metabolity, clearance, léčebná dávka)
Kauzální a akauzální modelovací nástroje. Specializované nástroje (VirtualCell, CellMl, BioTapestry, Physiome, Hummod etc). Využití knihoven v modelech. Obsah základních knihoven Modelica Library, Physiolibrary a jejich využitelnost.
Identifikace - definice úlohy, problém závislosti parametrů. Citlivostní analýza, velikost prohledávaného prostoru, chyba identifikace. Účelová funkce, lokální optima, Nástroje.
FMI - co to je, k čemu je to dobré. Varianty FMI. Nástroje FMI, využitelnost FMI v identifikační úloze.
Laplace obraz, přechodová funkce (přenos), odpověď systému na jednotkový skok a jednotkový impuls, uzavřená a otevřená smyčka, odezvy prvního a druhého řádu. Netlumená, tlumená kriticky tlumená a přetlumená odezva.
Zpětná vazba v systému. Kladná a záporná, vliv zpoždení. Prvky P, I a D v regulační zpětné vazbě.
Regulační systém, ustálený stav. Regulace chybou, referenční hodnota, regulace bez porovnávacího členu.
Analýza - statické charakteristiky, vliv nelinearit. Dynamické charakteristiky, odezva systému 1. a výšších řádů. Zpoždění. Kmitočtové charakteristiky, bodeho graf.
Vztah přenosové funkce a diferenciálních rovnic systému. Přenos, skládání přenosových funkcí.
Regulace a stabilita v biologických regulačních systémech. Specifika biologických systémů. Homeostáza, ultrastabilita, Multistabilita.