======A6M33MOS -- Modelování a simulace ====== [[http://cw.felk.cvut.cz/upload/|UploadSystem]] [[https://cw.felk.cvut.cz/forum/forum-1309.html|Diskusní fórum]] [[https://www.fel.cvut.cz/cz/education/rozvrhy-ng.B161/public/cz/predmety/17/06/p1706206.html|Rozvrh hodin]] ===== Přednášky a další materiály===== přednáší JK - Kofránek, FJ - Ježek, JŠ - Šilar, JP - Potůček - 5.10.2016 {{:courses:a6m33mos:pred1_uvodni_fj.pptx|Úvod do modelování}} (FJ) - 12.10.2016 [[https://docs.google.com/presentation/d/1ta77sLvUJIWn5wsEtmhkTRk39goar1eZdweQCn5LlBo/edit|Úvod do jazyka Modelica]] (FJ) - 19.10.2016 [[https://docs.google.com/presentation/d/1dCc-jyCcb0Y9yLW1_EEB38YERpaW1CWRxjTWCH2udb8/edit|Diskrétno a hybridno]] (FJ) - 26.10.2016 {{:courses:a6m33mos:2014_obecne_systemove_vlastnosti.ppt|Základní vlastnosti systémů}} (JK) - 2.11.2016 {{:courses:a6m33mos:zaklady_pm_2016.pdf|Modelování a optimalizovaná farmakoterapie}} (JP) - 9.11.2016 {{:courses:a6m33mos:analyza_linearnich_systemu_v_casove_domene_2016.pptx|Analýza lineárních regulačních systémů v časové doméně}} - 23.11.2016 {{:courses:a6m33mos:dynamika_a_regulace_ve_fyziologickych_systemech.pdf|Dynamika a regulace ve fyziologických systémech}} (JK) - 30.11.2016 {{:courses:a6m33mos:mos_numerika2016.pdf|Simulační metody, numerika}} (JŠ) - 7.12.2016 {{:courses:a6m33mos:mos_pred_repozitare_modelu.pdf|Repozitáře modelů}} (JK) - 14.12.2016 Parciální diferenciální rovnice * {{:courses:a6m33mos:partial_differential_equations_introduction_to_pdes.pdf|Úvod do PDE}} * {{:courses:a6m33mos:partial_differential_equations_time_dependent_problems..pdf|časově závislé}} - 21.12.2016 Knihovny * {{:courses:a6m33mos:pred2015-object_oriented_modeling.pdf|Využití dědičnosti}}(FJ) * {{:courses:a6m33mos:pred2015_physiolibrary_a_dalsi_uzitecne_knihovny.pdf|Physiolibrary}} * {{:courses:a6m33mos:pred2015_struktura_physiomodelu_v._1.1.pdf|Physiomodel}} - 4.1.2017 * {{:courses:a6m33mos:problemyidentifikace2.pdf|Problemy identifikace}} * {{:courses:a6m33mos:fmuaidentifikaceprezentace.pdf|Prezentace FMI}} * {{:courses:a6m33mos:prezentaceidentifikacehummod.pdf|Prezentace Identifikace modelu Hummod}} - 11.1.2017 Konzultační hodina k úloze a semestrálním pracím /* - 19.10.2015 [[https://docs.google.com/presentation/d/1ta77sLvUJIWn5wsEtmhkTRk39goar1eZdweQCn5LlBo/edit|Úvod do jazyka Modelica]] (FJ) - 21.10.2015 [[https://docs.google.com/presentation/d/1dCc-jyCcb0Y9yLW1_EEB38YERpaW1CWRxjTWCH2udb8/edit|Diskrétno a hybridno]] (FJ) - 4.11.2015 {{:courses:a6m33mos:2014_obecne_systemove_vlastnosti.ppt|Základní vlastnosti systémů}} (JK) - 11.11.2015 {{:courses:a6m33mos:jp_farmakokinetika2015.pdf|Farmakokinetika}} (Jiří Potůček) //update verze 16.11.// - 18.11.2015 Metoda konečných prvků (Tomáš Vampola) * [[http://mi21.vsb.cz/sites/mi21.vsb.cz/files/unit/numericke_metody_2.pdf|Doprovodná skripta]] - 25.11.2015 {{:courses:a6m33mos:pred7_numerika_silar.pdf|Modelica a numerika v pozadí}} (Jan Šilar) - 2.12.2015 {{:courses:a6m33mos:pred_08_analyza_linearnich_systemu_v_casove_domene_fj.pdf|Analýza lineárních systémů}} (FJ) - 9.12.2015 {{:courses:a6m33mos:dynamika_a_regulace_ve_fyziologickych_systemech.pdf|Dynamika a regulace ve fyziologických systémech}} (JK) - 16.12.2015 {{:courses:a6m33mos:pred2015-object_oriented_modeling.pdf|Pokročilé vlastnosti jazyka a dědičnost, využití knihoven}}(Tomáš Kulhánek) - 6.1.2016 Physiolibrary a Physiomodel (JK) * {{:courses:a6m33mos:pred2015_physiolibrary_a_dalsi_uzitecne_knihovny.pdf|Physiolibrary}} * {{:courses:a6m33mos:pred2015_struktura_physiomodelu_v._1.1.pdf|Physiomodel}} - 11.1.2016 Identifikace (Tomáš Kulhánek) * {{http://physiome.lf1.cuni.cz/mos/prezentace.pdf|Přednáška}} - 18.1.2016 Pokročilé funkce jazyka a prostředí Dymola * {{:courses:a6m33mos:mos_pred_repozitare_modelu.pdf|Repozitáře modelů}} * {{:courses:a6m33mos:mos_pred_frekvencni_analyza.pdf|Frekvenční analýza}} (Rozšíření) Důležitým zdrojem je také aplikace [[http://physiome.cz/atlas/sim/RegulaceSys/|Regulace]] ==== Přednášky 2014 ==== - 24.9.2014 {{:courses:a6m33mos:pred1_uvodni_fj.pptx|Úvod do modelování}} (FJ) - 1.10.2014 [[https://docs.google.com/presentation/d/1ta77sLvUJIWn5wsEtmhkTRk39goar1eZdweQCn5LlBo/edit|Úvod do jazyka Modelica]] (FJ) - 8.10.2014 {{:courses:a6m33mos:2014_obecne_systemove_vlastnosti.ppt|Základní vlastnosti systémů}} //Update verze 2014 (27.10.)// (JK) - 15.10.2014 [[https://docs.google.com/presentation/d/1dCc-jyCcb0Y9yLW1_EEB38YERpaW1CWRxjTWCH2udb8/edit|Diskrétní systémy v Modelice, události, pokročilé vlastnosti jazyka]] (FJ) - 22.10.2014 Analytické řešení diferenciálních rovnic (Jozef Nagy) - Řešení ordinérních diferenciálních rovnic prvního řádu a ntého řádu. Řešení soustav. Charakteristický polynom. Řešení nelineárních rovnic a jejihc řešitelnost. - 29.10.2014 {{:courses:a6m33mos:2014_numerika.pdf|Numerické metody, diferenciální rovnice a Modelica}} - Farmakokinetické a populační modely (JK) * {{:courses:a6m33mos:analyza_linearnich_systemu_v_casove_domene.pptx|Analýza lineárních systémů}} * {{:courses:a6m33mos:kompartmentova_analyza_v_epidemiologii_fziologii_a_farmakologii.pptx|Kompartmentová analýza}} - {{:courses:a6m33mos:ok_konceptualniho_modelu_k_simulacnimu_modelu.pptx|Od konceptuálního k simulačnímu modelu}} - {{:courses:a6m33mos:modelofhaemodynamics.zip|Ukázkový model}} - [[http://www.Physiolibrary.org|Physiolibrary]] a [[http://www.Physiomodel.org|Physiomodel]] (Marek Mateják) * {{:courses:a6m33mos:physiolibrary_v2.3.pptx|Physiolibrary}} * {{:courses:a6m33mos:physiomodel_v1.0.pptx|Physiomodel}} - Metoda konečných prvků (FEM) (Vampola) * [[http://mi21.vsb.cz/sites/mi21.vsb.cz/files/unit/numericke_metody_2.pdf|Doprovodná skripta]] - Identifikace * {{:courses:a6m33mos:problemyidentifikace2.pdf|Problemy identifikace}} * {{:courses:a6m33mos:fmuaidentifikaceprezentace.pdf|Prezentace FMI}} * {{:courses:a6m33mos:prezentaceidentifikacehummod.pdf|Prezentace Identifikace modelu Hummod}} - Analýza systémů a regulace (JK) * {{:courses:a6m33mos:dynamika_a_regulace_ve_fyziologickych_systemech.pptx|Dynamika a regulace}} * [[http://physiome.cz/atlas/sim/RegulaceSys/|Výuková aplikace]] - {{:courses:a6m33mos:modelovaci_nastroje_v_biologii_a_fyziologii.docx|Modelovací nástroje v biologii a ve fyziologii}} ==== Přednášky 2013 ==== - 25.9.2013 {{:courses:a6m33mos:pred1_uvodni_fj.pptx|Úvod do modelování}} (FJ) - 2.10.2013 [[https://docs.google.com/presentation/d/1ta77sLvUJIWn5wsEtmhkTRk39goar1eZdweQCn5LlBo/edit|Úvod do jazyka Modelica]] (FJ) - 9.10.2013 Zobecněné úsilí a zobecněný tok - {{:courses:a6m33mos:2013_mos3_kofr.pptx|základní vlastnosti systémů}}. (JK) - 16.10.2013 [[https://docs.google.com/presentation/d/1dCc-jyCcb0Y9yLW1_EEB38YERpaW1CWRxjTWCH2udb8/edit|Diskrétní systémy v Modelice, události, pokročilé vlastnosti jazyka]] (FJ) - 23.10.2013 {{:courses:a6m33mos:mos_prednaska4.pptx|Zobecněné úsilí a zobecněný tok II - Bond grafy}} - 30.11.2013 {{:courses:a6m33mos:odkonceprualnihomodeluksimulacnimumodelu.pptx|Od konceptuálního k simulačnímu modelu.}} {{:courses:a6m33mos:heamodynamicmeurs.zip|Model hemodynamiky}}(JK) - 6.11.2013 {{:courses:a6m33mos:dynamika_fyziologickych_systemu.pptx|Dynamika fyziologických systémů}} (JK) - 13.11.2013 Laplaceova transformace (Josef Nagy) * [[http://math.feld.cvut.cz/prucha/m2c/ltru.pdf|Skripta]] - 20.11.2013 {{:courses:a6m33mos:jp_farmakokinetika2013.ppt|Farmakokinetika}} (Jiří Potůček) - 27.11.2013 Systémy a modely, statická analýza (Jiří Potůček) * {{:courses:a6m33mos:identifikace_parametru_27.11.2013.ppt|identifikace}} - 4.12.2013 * {{:courses:a6m33mos:analyza_linearnich_regulacnich_systemu_v_casove_domene.ppt|}} - 11.12.2013 * {{:courses:a6m33mos:physiolibrary_v1.0.pptx|Physiolibrary prezentace}} * [[https://github.com/MarekMatejak/Physiolibrary|Knihovna Physiolibrary]] (stahujte nejaktuálnější verzi - odkaz vpravo) - 18.12.2013 * Simulace metodou konečných prvků (doc. Tomáš Vampola) * [[http://mi21.vsb.cz/sites/mi21.vsb.cz/files/unit/numericke_metody_2.pdf|Doprovodná skripta]] Další materiály na [[http://patf-biokyb.lf1.cuni.cz/wiki/cvut/mos_materialy|patf-biokyb wiki]] //(heslo nutné k přihlášení dostanete od cvičícího)// ==== Přednášky 2012: ==== - 19.9.2012{{:courses:a6m33mos:pred1_uvodni_jk.pptx|Úvod do modelování //PPTX//}} ({{:courses:a6m33mos:pred1_uvodni_jk.ppt|Úvod do modelování //PPT//}})(JK) - 26.9.2012 [[https://docs.google.com/presentation/d/1ta77sLvUJIWn5wsEtmhkTRk39goar1eZdweQCn5LlBo/edit|Základy jazyka Modelica]] (komentujte dle libosti)(FJ) - 3.10.2012 {{:courses:a6m33mos:pred3-obecnevlastnostisystemu.pptx|Obecné systémové vlastnosti, statická analýza}} {{:courses:a6m33mos:intro_bondgraphs.pdf|Doporučený článek}} (JK) - 10.10.2012 [[https://docs.google.com/presentation/d/1dCc-jyCcb0Y9yLW1_EEB38YERpaW1CWRxjTWCH2udb8/edit|Diskrétní systémy v Modelice, události, pokročilé vlastnosti jazyka]] * Doporučený článek: {{:courses:a6m33mos:whitepaper-designofhybridmodelica.pdf|Modelica hybrid systems design whitepaper}} (FJ) - 17.10.2012 (JK) Náplň přednášky je pokrytá v publikaci Khoo - physiological control Systems, kapitoly 1-3 - 24.10.2012 Přednáška pro nemoc odpadá, prostudujte si Khoo - physiological control Systems do strany 81 (Kapitola 4.1 - 4.3) - 31.10.2012 Časová analýza lineárních systémů (JK) - 7.11.2012 - 14.11.2012 {{:courses:a6m33mos:Modelování cirkulačního systému.pptx|Modelování hemodynamiky}}(JK) - 21.11.2012 - 28.11.2012 {{:courses:a6m33mos:mos_numerika.pdf|Numerické problémy}} (Janek Šilar) - 5.12.2012 Identifikace {{:courses:a6m33mos:identifikace_1_janek_diplomka.pdf|Prezentace k diplomce JŠ}} {{:courses:a6m33mos:identifikace_2.pdf|Přednáška}} (Janek Šilar) - 12.12.2012 {{:courses:a6m33mos:wunsch_regulace.ppt|Regulace v biologických systémech}} (doc. Wunsch) ==== Přednášky 2011: ==== - 12.10.2011 {{:courses:a6m33mos:pred_3_komponenty_a_konektory.pdf|Třídy, konektory}} (JK) - 19.10.2011 {{:courses:a6m33mos:pred_4_diskretnohybridno.ppt|Eventy, hybridni simulace}} (FJ) - 26.10.2011 System a model, stabilita, parametry, identifikace {{:courses:a6m33mos:pred_6_eck.ppt|Přednáška 6}} {{:courses:a6m33mos:biokybskripta.pdf|Skripta biokybernetika}} {{:courses:a6m33mos:mod_a_sim_bio_syst_holcik.pdf|Modelování a simulace biologických systémů}} (VE) - 2.11.2011 {{:courses:a6m33mos:pred7_eck.ppt|Základy teorie řízení}} (VE) - 9.11.2011 Principy biologických systémů a jejich modely, teorie řízení (VE) - Výňatky ze skript:{{:courses:a6m33mos:iam_uvod.pdf|Identifikace a modelování:Úvod}}, Teorie automatického řízení:{{:courses:a6m33mos:tar_identifikace.pdf|Identifikace}}, {{:courses:a6m33mos:tar_kriteria_stability_nyq.pdf|Kritéria stability}}, {{:courses:a6m33mos:tar_zbytky.pdf|Výňatky}} - 16.11.2011 Identifikace, verifikace, optimalizace {{:courses:a6m33mos:pred8.zip|Inverzní problém - citlivostní funkce a jiné}}(JP) - 23.11.2011 příklady biologických modelů - {{:courses:a6m33mos:potucek-2-farmakokinetika.ppt|farmakokinetika}} - 30.11.2011 Základy farmakokinetiky a optimální farmakoterapie, farmakokinetika, citlivostní funkce, určování parametrů (JP) - 7.12.2011 {{:courses:a6m33mos:12_epidemiologicke_modely.ppt|epidemiologické modely}} (JP) [[http://physiome.cz/atlas/sim/RegulaceSys/|Fyziologické modely]] (JK) - 14.12.2011 Modelování hierarchických fyziologických systémů, {{:courses:a6m33mos:mos_12_Kompartmenty.pptx|Kompartmenty}}, porovnání různých prostředí (JK) {{:courses:a6m33mos:IkedaModel.zip|IKEDA model}} {{:courses:a6m33mos:mos_13_Příklady.zip|Ukázky modelů z přednášky}} - 21.12.2011 Přehled modelů na buněčné, orgánové i systémové úrovni. Diskuse jejich použitelnosti.//Odpadlo z důvodu nemoci// (JK) */